Rak: Ova 4 gena pomažu u predviđanju ishoda
Opsežno istraživanje uloge supresora tumora p53 nudi veće razumijevanje genetskih mutacija koje se igraju u različitim oblicima raka, kao i identificiranje četiri gena koji mogu pomoći u predviđanju izgleda osobe.
The TP53 gen je odgovoran za kodiranje onoga što znanstvenici nazivaju tumorskim proteinom p53 - supresorom tumora koji može zaustaviti stanice da se prebrzo dijele i šire.
Istraživači su sinkronizirali TP53 "čuvar genoma" zbog svoje presudne uloge u prevenciji tumora i kontroliranju stanične diobe.
Ljudski karcinomi često imaju mutacije u TP53 gen, što uzrokuje neuspjeh jednog od kritičnih obrambenih mehanizama protiv raka.
Prve studije koje su identificirale TP53 mutacije u ljudskom raku pojavile su se 1980-ih i od tada su istraživači posvetili puno vremena i resursa pojašnjavanju njegove uloge u raku.
Sada, najveća studija ove vrste koristi uzorke tumora od preko 10 000 pacijenata s rakom i proučava 32 različite vrste raka kako bi bolje razumjela ulogu TP53.
Dr. Larry Donehower, profesor molekularne virologije i mikrobiologije na Medicinskom fakultetu Baylor u Houstonu, TX, vodio je novo istraživanje koje se pojavljuje u časopisu Izvješća o ćelijama.
Geni Telltale 4 mogu pomoći u predviđanju izgleda
Doktor Donehower i tim koristili su pet različitih podatkovnih platformi za vađenje 10.225 uzoraka iz 32 karcinoma. Koristeći Atlas genoma raka (TCGA), istraživači su uspjeli sveobuhvatno procijeniti ulogu puta p53 u ova 32 karcinoma.
Tada su dr. Donehower i kolege usporedili podatke TCGA s drugom bazom podataka o 80 000 genetskih mutacija koju je dr. Thierry Soussi - profesor molekularne biologije na Sveučilištu Sorbonne u Parizu, Francuska - sakupljao tijekom razdoblja od 30 godina.
Istraživači su to otkrili TP53 mutacije su se češće javljale kod ljudi koji su imali lošiji izgled. Nadalje, analiza je pokazala da „Više od 91% karcinoma s TP53 mutacije pokazuju gubitak oba funkcionalna TP53 aleli «, ili varijante gena.
Dr. Donehower objašnjava: "U nekim genima karcinoma vidjet ćete jednu kopiju dva gena izgubljena ili mutirana", ali "preko 91 posto svih karcinoma gubi oba TP53 geni, ne samo jedan. "
Drugi gubitak alela, pišu autori, dogodio se "mutacijom, kromosomskom delecijom ili gubitkom heterozigotnosti neutralnim od kopiranja" - odnosno umnožavanjem gena. Vodeći istraživač također primjećuje da se ovaj posljednji proces dogodio mnogo češće nego što su prije vjerovali.
Važno je što je istraživanje također identificiralo četiri gena koji su pokazali prekomjernu ekspresiju kod mutanata TP53 tumori. Prema istraživačima, ova četiri gena mogu "reći" ima li bolesnik s rakom dobre izglede ili ne.
„Ako imate visoku ekspresiju ta četiri gena, imate pacijenta za kojeg je vjerojatnije da ima lošu prognozu […] Suprotno tome, ako taj pacijent ima vrlo nisku ekspresiju tih gena, vjerojatno će dulje preživjeti i imati dobra prognoza. "
Dr. Larry Donehower
„To će vam dati bolju sliku o tome kako će proći nego samo znati je li mutant TP53 ili ne ”, nastavlja dr. Donehower.
Konačno, studija je snažno povezana TP53 mutacije s genomskom nestabilnošću, nalaz koji je u skladu s TP53Tipična uloga "čuvara genoma".
Dr. Donehower komentira jedinstvenost novog istraživanja, rekavši: „Većina studija o TP53 usredotočite se na jedan tip karcinoma. "
"Gledajući 32 različite vrste karcinoma, vidite da se određeni obrasci održavaju bez obzira na vrstu karcinoma."
Koautor studije i direktor Genomics of Cancer na Medicinskom fakultetu Baylor, dr. David Wheeler, također komentira značaj nalaza.
Kaže: „Od TP53 jedan je od najvažnijih vratara u prevenciji raka, što bolje razumijemo ovaj gen, to ćemo biti sposobniji razumjeti osnovnu biologiju raka. To će dovesti do boljih terapija. "
