Prevencija herpeskih infekcija: Studija nudi nove uvide
Novo istraživanje identificira ključni čimbenik koji određuje napredovanje virusa herpesa i pokazuje da njegovo ciljanje može usporiti virusno napredovanje.
Prema najnovijim statistikama Centra za kontrolu i prevenciju bolesti (CDC), u razdoblju 2015. - 2016. gotovo 48% ljudi u Sjedinjenim Državama živjelo je s herpes simplexom 1, virusnim sojem koji uzrokuje oralne infekcije.
Širom svijeta 80% populacije ima virus. Jednom kada se osoba zarazi, virus nikada ne nestaje - ostaje miran u njegovom tijelu tijekom cijelog života.
Iako simptomi herpesa ponekad prođu nezapaženo, za neke ljude oni mogu biti neugodni i bolni.
Virus herpesa je također vrlo zarazan, jer ga osoba može prenijeti čak i kad nema nikakvih simptoma.
Nova istraživanja sugeriraju da bi zaražavanje virusom moglo uskoro biti spriječeno, jer znanstvenici nude nove uvide u to što se događa na staničnoj razini tijekom infekcije herpesom i pronalaze način za usporavanje napredovanja infekcije.
Emanuel Wyler i dr. Vedran Franke s Berlinskog instituta za biologiju medicinskih sustava u Njemačkoj suaktivni su autori novog rada koji se pojavljuje u časopisu Prirodne komunikacije.
Važnost NRF2 transkripcijskog faktora
Znanstvenici su razvili algoritam koji im je omogućio da predvide kako će infekcija napredovati u pojedinim stanicama.
Istraživači su koristili sekvenciranje jednoćelijske RNK za analizu 12 000 ljudskih stanica kože zaraženih virusom herpes simplex 1 (HSV1). Sekvenciranje jednoćelijske RNA revolucionarna je tehnika koja omogućava razgradnju genetičkih izraza na puno zrnatijoj razini od skupnog sekvenciranja RNA.
Istraživači objašnjavaju razliku između sekvenciranja jednostruke RNA i konvencionalnog skupnog sekvenciranja RNA analogijom smoothieja.
"Ako u blender ubacim deset vrsta voća, mogu otprilike reći da smoothie sadrži recimo kupine kad ga kušam", objašnjava Wyler. “S jednostaničnim sekvenciranjem RNA ne radimo smoothie - radimo voćnu salatu. Odmah mogu prepoznati kupine i reći koliko ih je točno u salati. "
Tehnika, kombinirana s algoritmom, otkrila je istraživačima da transkripcijski faktor nazvan NRF2 igra ključnu ulogu, a njegova aktivacija inhibira napredovanje infekcije.
Transkripcijski faktori su proteini koji "dekodiraju" informacije iz našeg genoma i aktiviraju ili deaktiviraju određene gene vežući se na određene DNA regije.
Franke objašnjava kako je nova tehnika otkrila značaj transkripcijskog faktora NRF2.
"Vizualizirao sam promjene u regulaciji svakog gena koji smo istraživali u jednoj stanici", kaže on. "Ovo nam je pokazalo da razina aktivacije NRF2 transkripcijskog faktora može biti marker za privremenu otpornost na HSV1 infekciju."
Istraživači su također otkrili da dva NRF2 agonista ili aktivatora, nazvana bardoksolon metil i sulforafan, narušavaju proizvodnju virusa, odnosno čine da virus aktivira manje vlastitih gena. To je istraživačima potvrdilo ključnu ulogu NRF2.
Bardoksolon metil je lijek namijenjen liječenju kronične infekcije bubrega. Trenutno je u trećoj fazi kliničkih ispitivanja.
Konačno, studija je također otkrila da stadij staničnog ciklusa također utječe na to koliko je stanica osjetljiva na HSV1 infekciju.
Istraživači objašnjavaju da je virus herpesa dobar "opći nacrt" za istraživanje staničnih stanja kod virusnih infekcija, a planiraju koristiti sekvenciranje jednoćelijske RNA za proučavanje budućih virusa.
